1. 大多數細胞成分是無色的，在顯微鏡下無法清楚地區分。熒光顯微鏡的基本前提是用染料對組分進行染色。
2. 熒光染料，也稱為熒光團或熒光染料，是吸收給定波長（通常為UV）的激發光，并在短暫的延遲后發出更長波長的光的分子。吸收和發射之間的延遲可以忽略不計，通常約為納秒。
3. 然后可以從激發光中濾出發射光以揭示熒光團的位置。

• 熒光顯微鏡使用強度更高的光照射樣品。該光激發樣品中的熒光物質，然后發出更長波長的光。
• 產生的圖像基于第二種光源或熒光物質的發射波長，而不是zui初用于照明和激發樣品的光。

加工

激發波長的光通過物鏡聚焦在樣品上。樣品發出的熒光通過物鏡聚焦在檢測器上。由于大多數激發光都透射過樣品，因此只有反射的激發光與發射光一起到達物鏡。

形式

“熒光顯微鏡”是指使用熒光生成圖像的任何顯微鏡，無論是諸如落射熒光顯微鏡這樣的更簡單的裝置，還是諸如共焦顯微鏡之類的更復雜的設計，其都使用光學切片來獲得更好的分辨率。熒光圖像。

使用的大多數熒光顯微鏡是落射熒光顯微鏡，其中熒光團的激發和熒光的檢測是通過相同的光路（即通過物鏡）完成的。